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短信通知手续费一般计入企业财务费用科目。

财务费用科目包括利息支出、汇兑损益、支付金融机构手续费等，对于银行发生的短信通知手续费，可以视作一种支付金融机构手续费的行为，计入财务费用科目，具体的会计处理为：借财务费用科目，贷银行存款科目。

仅供参考，建议咨询财务专业人士以获得更多信息。